Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms