Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRXP46100 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRXP46100 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms