Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR4P46093 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR4P46093 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR4P46093 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms