Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AFMP43652 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AFMP43652 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AFMP43652 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms