Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV3P41162 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV3P41162 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV3P41162 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms