Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBRP36941 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LTBRP36941 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBRP36941 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms