Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms