Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms