Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PLNP26678 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PLNP26678 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PLNP26678 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms