Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms