Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF3P18847 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF3P18847 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms