Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms