Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms