Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms