Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms