Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms