Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR2F1P10589 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms