Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HKR1P10072 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms