Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00032P0C843 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms