Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCP08575 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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