Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRPRAP08240 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms