Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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