Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms