Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GCATO75600 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCATO75600 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms