Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms