Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DENRO43583 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DENRO43583 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DENRO43583 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DENRO43583 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DENRO43583 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DENRO43583 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DENRO43583 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DENRO43583 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DENRO43583 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DENRO43583 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DENRO43583 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms