Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms