Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf172C9J069 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms