Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms