Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms