Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF316A6NFI3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms