Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIPSLA2A3N6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms