Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCAF1Q9Y4B6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCAF1Q9Y4B6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms