Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms