Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms