Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms