Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms