Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
ALKQ9UM73 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKQ9UM73 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms