Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI4Q9UM07 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms