Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TPCN1Q9ULQ1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPCN1Q9ULQ1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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