Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms