Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO40Q9UH90 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms