Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms