Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms