Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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