Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms