Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms