Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms