Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms