Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT57Q9NWB7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms